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2024年终总结

2024-12-31T22:49:45+08:00

Pepper

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抗体亲和力成熟的设计

2024-10-20T17:35:16+08:00

本文提出一个可预训练的深度神经网络，利用多层次几何信息传递来模拟复杂的蛋白质-蛋白质相互作用。

Pepper

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被AI包揽的2024年Nobel Prize

2024-10-10T13:39:01+08:00

到目前为止，诺贝尔基础科学的两大奖项都颁给了AI创新者：

生理学或医学奖：维克多·安布罗斯（Victor Ambros）和加里·鲁夫昆（Gary Ruvkun）发现微小RNA（microRNA），揭示了基因调控的新机制，对疾病治疗具有潜在重要意义。

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AI4S大模型一则范例

2024-10-08T23:43:55+08:00

神经网络揭秘GPCR-G蛋白偶联选择性

看到头图的研究还是非常震惊的，二元分类神经网络用来预测范围广泛的GPCR家族的G蛋白选择性了，并找到了一些相关的pattern。

Pepper

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Nature|计算设计可溶有功能膜蛋白类似物

2024-10-08T21:04:28+08:00

一种基于深度学习的从头蛋白质设计计算流程。

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BindCraft————功能性蛋白质binder的设计

2024-10-06T15:18:49+08:00

一个用于从头蛋白质结合剂设计的开源自动化流程，实验成功率号称10-100%。BindCraft利用 AlphaFold2经过训练的深度学习权重来生成纳摩尔结合剂，而无需高通量筛选或实验优化，即使在没有已知结合位点的情况下也是如此。成功地针对多种具有挑战性的靶标设计了结合剂，包括细胞表面受体、常见过敏原、从头设计的蛋白质和多域核酸酶，例如CRISPR-Cas9。

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David baker蛋白质设计方法

2024-09-27T17:25:47+08:00

如何搭建自己的博客

2024-09-21T19:11:45+08:00

Hugo简介

Hugo建站优点

1. 超高速的生成速度

• 快速构建：Hugo 能在几秒钟内生成上千个页面，大大提高了开发效率。
• 即时预览：内置的开发服务器支持实时预览，更改内容后页面立即刷新。

2. 简单易用

• 易于安装：无需复杂的依赖环境，下载即可使用。

Pepper

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GPCR概览

2024-09-20T20:09:58+08:00

前沿

GPCR的定义

G蛋白偶联受体(GPCR)家族是最大和研究最多的细胞表面蛋白家族之一，在人类基因组中发现了近800个成员。GPCRs是七种跨膜受体蛋白，它们被一系列刺激物激活，包括蛋白质、肽、脂质、氨基酸、离子、生物胺、光和气味剂。

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Illumina测序数据研究

2024-09-16T15:16:40Z

测序原理

sanger法测序及双脱氧链终止法，它采取DNA复制原理，通过在DNA复制过程中添加双脱氧三磷酸核苷酸（ddNTP）终止DNA链的延伸，在DNA链不同位置的延伸终止判断该位置的碱基类型。但是凝胶电泳的时间较长，导致sanger法测序通量低。illumina测序技术可以实现高通量，低成本，测序长度较短。